MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 6312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	CAA	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017303	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017303	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017303	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017303	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017303	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017303	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017303	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017303	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017303	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017303	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017303	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017303	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017303	TCGC	2	8	8250	8257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017303	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017303	T	6	6	8287	8292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017303	TTA	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017303	TGC	2	6	12021	12026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017303	GTT	2	6	12091	12096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017303	GT	3	6	12101	12106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017303	AAC	2	6	12255	12260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017303	AGG	2	6	12301	12306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017303	TGT	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017303	GAA	2	6	13214	13219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017303	GCC	2	6	13223	13228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017303	T	7	7	13263	13269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017303	GT	3	6	13329	13334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017303	GGT	2	6	13361	13366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017303	T	6	6	13378	13383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017303	GAC	2	6	13462	13467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017303	CAA	2	6	13490	13495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017303	CAT	2	6	13500	13505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017303	TTATC	2	10	14086	14095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017303	TGT	2	6	14158	14163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017303	ACGTA	2	10	14249	14258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017303	AGG	2	6	14328	14333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017303	CAGTA	2	10	14632	14641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017303	A	6	6	17567	17572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017303	TAGCG	2	10	18331	18340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017303	GAA	2	6	20102	20107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017303	GAAA	2	8	20227	20234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017303	TGG	2	6	20283	20288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017303	GCT	2	6	20369	20374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017303	CGA	2	6	20408	20413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017303	CAG	2	6	20561	20566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017303	AGT	2	6	21035	21040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017303	GAG	2	6	21205	21210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017303	GAT	2	6	21321	21326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017303	GCA	2	6	21367	21372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017303	AGCTTC	2	12	21472	21483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017303	TTTTCT	2	12	22075	22086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017303	TC	3	6	22603	22608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017303	TAT	2	6	22634	22639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017303	CGA	2	6	23584	23589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017303	T	6	6	23645	23650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017303	AAT	2	6	23705	23710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017303	AGC	2	6	23712	23717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017303	T	6	6	23763	23768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017303	TCAT	2	8	23819	23826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017303	TGAT	2	8	23837	23844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017303	CT	3	6	23878	23883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017303	TTG	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017303	GCTA	2	8	29131	29138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017303	TC	3	6	29159	29164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017303	TAT	2	6	29177	29182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017303	TA	3	6	29537	29542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017303	GAG	2	6	37973	37978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017303	CCT	2	6	39013	39018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017303	TACT	2	8	39039	39046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017303	GCA	2	6	39075	39080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017303	TAG	2	6	39115	39120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017303	AAGA	2	8	39121	39128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017303	ATT	2	6	39334	39339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017303	CAC	2	6	39344	39349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017303	C	7	7	39423	39429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_017303	T	6	6	39501	39506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017303	TGCG	2	8	39571	39578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017303	CACAT	2	10	39590	39599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017303	TGT	2	6	40400	40405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017303	CCT	2	6	41365	41370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017303	TTC	2	6	41371	41376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017303	ATA	2	6	41396	41401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017303	TA	3	6	41400	41405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017303	GCTG	2	8	41459	41466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017303	TGA	2	6	41528	41533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017303	AATG	2	8	44454	44461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017303	CG	3	6	44481	44486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017303	CCT	2	6	46041	46046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017303	ATT	2	6	46085	46090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017303	AAAT	2	8	46098	46105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017303	TGT	2	6	46149	46154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017303	TTGC	2	8	47827	47834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017303	AGC	2	6	47855	47860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017303	TTG	2	6	47871	47876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017303	GTT	2	6	47893	47898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017303	ATTA	2	8	47902	47909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017303	TTG	2	6	47981	47986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017303	ACT	2	6	48360	48365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017303	TGG	2	6	48428	48433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017303	TAT	2	6	48442	48447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017303	T	6	6	48465	48470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017303	T	6	6	49852	49857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017303	AAG	2	6	49865	49870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017303	TTC	2	6	50025	50030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017303	TCA	2	6	50040	50045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017303	T	6	6	50127	50132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017303	A	6	6	50191	50196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017303	GTG	2	6	50229	50234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017303	TCA	2	6	50238	50243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017303	AAG	2	6	50368	50373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017303	TAA	2	6	50627	50632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017303	ATC	2	6	50671	50676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017303	TGG	2	6	50850	50855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017303	CG	3	6	50862	50867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017303	AC	3	6	50876	50881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017303	GTTT	2	8	50904	50911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017303	TGT	2	6	52662	52667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017303	TTGGA	2	10	52673	52682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017303	AAC	2	6	52691	52696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017303	TTGAT	2	10	52708	52717	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017303	CTT	2	6	52784	52789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017303	TGCAC	2	10	52802	52811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017303	TGC	2	6	52815	52820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017303	TTG	3	9	52823	52831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017303	CGT	2	6	52832	52837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017303	GCC	2	6	52851	52856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017303	AC	3	6	52931	52936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017303	T	6	6	54625	54630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017303	CCA	2	6	54671	54676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017303	A	6	6	54684	54689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017303	GA	3	6	54743	54748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017303	TGG	2	6	57724	57729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017303	CAT	2	6	57769	57774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017303	AGC	2	6	57801	57806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017303	TTGG	2	8	57813	57820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017303	TGC	3	9	57868	57876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017303	CTT	2	6	59652	59657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017303	ACC	2	6	59658	59663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017303	ACG	2	6	59673	59678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017303	GCAC	2	8	59685	59692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017303	GAG	2	6	59717	59722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017303	CTTT	2	8	61447	61454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017303	T	7	7	61452	61458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017303	AAG	2	6	64529	64534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017303	ACT	2	6	64544	64549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017303	TCTGT	2	10	64664	64673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017303	AAT	2	6	64729	64734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017303	TTG	2	6	65968	65973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017303	ATG	2	6	67128	67133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017303	T	6	6	67249	67254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017303	GAA	2	6	67265	67270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017303	T	6	6	68153	68158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017303	A	6	6	68183	68188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017303	TGC	2	6	68282	68287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017303	GGA	2	6	68297	68302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017303	TCT	2	6	68305	68310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017303	AGT	2	6	68342	68347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017303	AGTG	2	8	69223	69230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017303	TGA	2	6	71361	71366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017303	AAG	2	6	71406	71411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017303	ATA	2	6	71441	71446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017303	ATT	2	6	71478	71483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017303	GAA	2	6	71586	71591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017303	GGA	2	6	71709	71714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017303	ACT	2	6	71927	71932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_017303	TAATT	2	10	76511	76520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017303	TAAT	2	8	76531	76538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_017303	TCT	2	6	79969	79974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017303	T	6	6	88175	88180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017303	GTA	2	6	93595	93600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017303	GGT	2	6	106552	106557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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